Структурные подразделения образовательной организации: структурных подразделений в МБОУ № 16 г. Липецка нет.
Органы управления образовательным учреждением: Управление МБОУ № 16 г. Липецка осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Единоличным исполнительным органом Учреждения является Директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью Учреждения.
Полномочия органов управления регулируются Уставом МБОУ № 16 г. Липецка.